文章摘要:扩展蛋白是细胞壁的重要组成部分，具有疏松细胞壁、增加细胞壁柔韧性的作用，广泛存在于植物基因组中。本研究以中华猕猴桃(Actinidia chinensis)红阳基因组序列为基础，通过毛果杨扩展蛋白序列进行特征结构域比对从而获得猕猴桃扩展蛋白序列信息。通过生物信息和密码子分析软件对猕猴桃扩展蛋白基因进行研究，从而得到基因家族特征和密码子偏好信息。猕猴桃扩展蛋白基因家族包含39个成员，分属于AcEXPA(28)、AcEXPB(6)、AcEXPLA(1)和AcEXPLB(4) 4个亚家族，其中的36个成员定位于22个染色体中。氨基酸组成分析显示，Gly含量最高(11.74%)，而His含量最低(1.91%)。密码子特性分析显示，猕猴桃扩展蛋白第3位碱基更偏好使用嘧啶类，序列GC值趋向于平均使用。通过同义密码子相对使用频率分析发现，扩展蛋白共有高频密码子8个，且均以G/C碱基结尾。对猕猴桃植株进行逆境胁迫处理后分别有3、14、7、6个基因参与低温、高温、干旱和盐胁迫响应。通过对猕猴桃扩展蛋白基因家族的鉴定和密码子用法及功能分析有利于认识其在猕猴桃基因组中的组成特点、表达效率特点，也为今后扩展蛋白在猕猴桃中的作用以及异源表达研究提供一定基础。

文章关键词:猕猴桃,扩展蛋白,基因家族,密码子偏性,基因功能,

论文作者:李健¹ 尹鹏² 王海荣¹ 安淼¹ 李国田¹ 

作者单位:1. 山东省果树研究所 2. 北京林业大学 

论文分类号: S663.4

相似文献:四种蔷薇科果树叶绿体基因组密码子偏好性分析.....作者:刘兴跃,何仲坚,邱毅敏,刊载期刊：《分子植物育种》
芒果叶绿体基因组密码子使用偏好性分析.....作者:唐玉娟,赵英,黄国弟,付海天,宋恩亮,李日旺,金刚,刊载期刊：《热带作物学报》
‘玉铃铛’枣叶绿体基因组特征及密码子偏性.....作者:郭晓雨,张晓慧,马宗新,李文峰,李慧慧,刊载期刊：《分子植物育种》
杧果叶绿体基因组密码子使用偏好性分析.....作者:辛雅萱,黎若竹,李鑫,陈丽琼,唐军荣,屈亚亚,杨琳懿,辛培尧,李云芳,刊载期刊：《中南林业科技大学学报》
铁核桃叶绿体基因组密码子偏好性分析.....作者:原晓龙,郝佳波,王毅,陆斌,刊载期刊：《分子植物育种》
双孢蘑菇基因组密码子的偏好性分析.....作者:韩利红,代冬琴,赵明玉,刘潮,刊载期刊：《菌物学报》
迎春樱桃叶绿体基因组特征及其密码子使用偏好性分析.....作者:叶琦,宋炎峰,李蒙,伊贤贵,王绍军,王贤荣,刊载期刊：《分子植物育种》
湖北山楂叶绿体基因组密码子偏好性分析.....作者:吴学俊,梁湘兰,易子群,罗秋香,张鹏,郭松,覃逸明,刊载期刊：《分子植物育种》
胡萝卜(Daucus carota var.sativa)密码子偏好性及属内质体基因组核苷酸多样性分析.....作者:康路,谢登峰,何兴金,刊载期刊：《分子植物育种》
大山樱叶绿体基因组特征及密码子偏好性分析.....作者:李蒙,叶琦,宋炎峰,吴水涵,伊贤贵,王贤荣,刊载期刊：《分子植物育种》

相关文章:果树高光效树形标准化整形修剪技术.....作者:牛自勉
新时代山西红枣栽培技术与发展趋势.....作者:贺润平

文章来源：《植物学报》 网址: http://www.zwxbzz.cn/qikandaodu/2021/0820/1575.html

上一篇： 园艺论文_紫玉兰‘红元宝’花芽分化阶段基因
下一篇： 农作物论文_外源2，4-表油菜素内酯对干旱胁迫