文章目录

1 材料与方法

1.1 试验材料

1.2 试验方法

    1.2.1 DHHC型锌指蛋白基因家族鉴定

    1.2.2 DHHC型锌指蛋白基因家族的生物信息学分析

2 结果与分析

2.1 油茶DHHC型锌指蛋白基因家族的鉴定

2.2 油茶DHHC型锌指蛋白保守结构域和基序分析

2.3 油茶DHHC型锌指蛋白基因家族进化关系分析

2.4 油茶DHHC型锌指蛋白基因家族的表达分析

3 结论与讨论

文章摘要:DHHC型锌指蛋白参与细胞内蛋白质的棕榈酰化修饰,对植物的生长发育、器官形成、生殖发育及胁迫响应等生命活动具有重要的调控作用。基于油茶叶片转录组数据,筛选出23个DHHC型锌指蛋白基因,应用生物信息学方法对其蛋白理化性质、结构域、系统进化等进行了分析。结果表明,23个DHHC型锌指蛋白的序列大小为195～725 aa,均包含一个保守的DHHC-CRD结构域,大部分DHHC型锌指蛋白具有4个跨膜区,主要定位于细胞核和细胞膜中。系统进化分析将其分为4类,与拟南芥和水稻均有不同程度的同源关系,DHHC型锌指蛋白在不同物种间具有遗传保守性。23个DHHC型锌指蛋白基因在结实量大和结实量小的单株的不同发育时期叶片中均有不同程度的表达。CoDHHC9、CoDHHC13、CoDHHC22在油茶抽梢生长期的叶片中表达上调;CoDHHC6、CoDHHC12、CoDHHC18、CoDHHC23在花芽分化时期和果实成熟时期的叶片中表达量较高,且在结实量较小而开花较多的单株中表达上调更为明显,这些基因可能参与油茶花芽分化及花朵发育过程;CoDHHC5、CoDHHC11、CoDHHC15在不同时期的叶片中表达量均较低。研究结果为进一步对油茶DHHC型锌指蛋白家族基因的克隆和功能分析提供了依据,有助于进一步研究该基因家族在油茶生殖发育中的调控功能。

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